Музей хранит уникальное собрание археологических материалов и произведений древнерусского прикладного искусства X-XII веков. Несколько тысяч памятников - от фрагментов фресок и мозаик церкви Успения Богоматери (Десятинной ), первого кафедрального храма Киевской Руси, до бытовых вещей из различных материалов дают всестороннее представление о культуре Киева периода расцвета - XI-XIII столетий. Памятники, уничтоженных татарами в 1240-41 годах - Изяславля на Волыни и крепости Райки на Днепре, характеризуют материальную и духовную культуру периферийных центров древнерусских княжеств. Гордостью собрания являются материалы многолетних раскопок в Пскове, среди которых хорошо сохранившиеся изделия из кожи и дерева. 

Среди произведений прикладного искусства эпохи средневековья особого внимания заслуживают памятники мелкой культовой пластики XIII-XVII веков. Великолепны каменные резные иконки "Св. Лука и св. Георгий", возможно, принадлежавший великому князю владимирскому Георгию Всеволодовичу, "Св. Николай и семь отроков эфесских" новгородской работы XIV века, панагия "Троица Ветхозаветная", созданная в XV веке. Привлекают внимание тонкостью резьбы деревянные иконки XVI-XVII веков.

Уникальным памятником ювелирного искусства XII века является золотая с перегородчатой эмалью пластина княжеской диадемы, по-видимому, киевской работы. 

Особую группу в собрании произведений древнерусского прикладного искусства XVI-XVII столетий образуют изделия из драгоценных металлов, созданные в Москве и крупных ремесленных центрах Московского царства. Среди них золотой с эмалями крест, принадлежавший патриарху Филарету, отцу первого царя из династии Романовых, икона "Богоматерь Умиление" в окладе с драгоценными камнями, украшения, образцы парадной пиршественной посуды, туалетные принадлежности.

Весьма интересна небольшая коллекция памятников лицевого шитья, среди которых выделяется созданный, по-видимому, в костромских мастерских покров на раку св. Сильвестра Обнорского, датируемый XVI веком. 

Представлены в собрании и предметы повседневного обихода рядовых горожан эпохи позднего средневековья. 

Чаша Сольвычегодск Конец XVIIв. Изображение большего размера		Евангелие Москва 1555 г. Изображение большего размера
Корчик Москва XVII в. Изображение большего размера