Торжественное открытие фондохранилища состоялось 16 мая 2003 г. и было приурочено к 300-летию Санкт-Петербурга. На первом этапе были возведены: Административный, Фондовый и Инженерный корпуса; Котельная.
В проекте использовались современные подходы к организации хранения, реставрации, информационному обеспечению, а также учтены последние достижения в области системы безопасности.
Семиэтажный Фондовый корпус, имеющий полезную площадь свыше 16 000 кв.м, оснащен специальным оборудованием, в т.ч. системой формирования климата.
В Фондовом корпусе на данном этапе размещаются коллекции Отдела западноевропейского искусства, Отдела истории русской культуры, Отдела Востока, Отдела археологии Восточной Европы, а также Лаборатории научной реставрации станковой живописи.
Вместе с тем оно отличается от традиционных музейных хранилищ применением принципа так называемого открытого хранения. Знакомство с фондами осуществляется по определенному маршруту, в продолжение которого посетители имеют возможность познакомиться с основными принципами и условиями хранения музейных экспонатов.